对于药品来说，从实验室样品到商业生产都受到严格的标准管控，这是为了确保产品的纯度和质量。Mixcore真空均质乳化机可以按照工艺需求进行设计，以满足不同的生产需要。例如，纯化水可以通过流量计直接从罐顶注入主罐体内部，其他的原料可以通过均质器混料腔周围的进料口加入。原料的加入可以是非无菌的，也可以是无菌的，并支持粉末加入或其他不同的接口形式。如果需要将无菌粉末加入系统，则可以将系统与配备的隔离器相对接;隔离器带有层流系统，并且带压工作，同时也可配备集成式的称重站，整个内部可以用过氧化氢进行消毒保护。以这种方式配置隔离器可为无菌加料提供充分的产品保护，同时也能对操作员进行保护，这在添加高活性成分时至关重要。
如果企业采用的工艺允许对真空乳化机设备进行在线清洗(CIP)，那么Mixcore真空均质乳化机就可以为工艺增设在线灭菌(SIP)的功能，在线灭菌既可以针对整个系统，也可以按照需求针对特定部分的组件。为此，Mixcore真空乳化机的均质器以及搅拌系统都可配置双层机械密封，且支持对机械密封屏障液进行灭菌，并将所有管道保持在了同一梯度。即使是设计方面无法避免的末端，也符合相关的制造标准。为了满足更小死区、更佳清洗能力和更小产品损失的要求，在整个生产系统中，Mixcore真空乳化机使用了隔膜阀和/或隔膜阀组。
为了能适应在生产不同的产品之后以不同的方式对装置进行清洁，CIP/SIP还被分解成许多基本操作，以便为任何给定的产品配置合适的清洁程序。由于系统无菌是一个重要的标准，所以不同测量点的温度记录都会被集中保存(即温度映射)，并作为验证系统无菌的基础。系统运行时，会监测所有关键点的温度，记录每个测量点，并在灭菌方案中显示。直到灭菌成功完成后，该系统才能通过无菌认定并进行生产。
